Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn34b3Q80ZS5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms