Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cracr2bQ80ZJ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cracr2bQ80ZJ8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms