Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Negr1Q80Z24 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Negr1Q80Z24 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms