Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rbbp8Q80YR6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms