Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Lrfn4Q80XU8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrfn4Q80XU8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrfn4Q80XU8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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