Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Npm2Q80W85 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Npm2Q80W85 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
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Npm2Q80W85 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
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Npm2Q80W85 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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Npm2Q80W85 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Npm2Q80W85 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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Npm2Q80W85 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms