Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Pcsk9Q80W65 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pcsk9Q80W65 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pcsk9Q80W65 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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