Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ttc29Q80VM3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms