Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Polr2eQ80UW8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Polr2eQ80UW8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms