Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cep170bQ80U49 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cep170bQ80U49 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178 ms