Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

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Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Arhgef17Q80U35 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Arhgef17Q80U35 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Arhgef17Q80U35 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Arhgef17Q80U35 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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