Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pja2Q80U04 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pja2Q80U04 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms