Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lamp3Q7TST5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lamp3Q7TST5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms