Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms