Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nek5Q7TSC3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms