Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ckap2lQ7TS74 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms