Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Tnfsf18Q7TS55 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tnfsf18Q7TS55 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms