Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Znf250Q7TNU6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms