Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pkd1l2Q7TN88 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkd1l2Q7TN88 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms