Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Msrb2Q78J03 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Msrb2Q78J03 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms