Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rpl35Q6ZWV7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl35Q6ZWV7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms