Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Syne2Q6ZWQ0 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms