Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RfflQ6ZQM0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RfflQ6ZQM0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms