Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Topbp1Q6ZQF0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Topbp1Q6ZQF0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms