Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ino80Q6ZPV2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ino80Q6ZPV2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms