Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rhox8Q6VSS7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms