Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gja6Q6S5G4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gja6Q6S5G4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms