Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc57Q6PHN1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms