Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF93

Pik3c3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c3Q6PF93 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pik3c3Q6PF93 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pik3c3Q6PF93 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms