Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gramd2bQ6PEM6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gramd2bQ6PEM6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms