Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Snrnp40Q6PE01 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snrnp40Q6PE01 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms