Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rundc3bQ6PDC0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rundc3bQ6PDC0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms