Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atl2Q6PA06 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atl2Q6PA06 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms