Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx6Q6P8X1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Snx6Q6P8X1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms