Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nwd2Q6P5U7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nwd2Q6P5U7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms