Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E8

Efcab6, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab6Q6P1E8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Efcab6Q6P1E8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab6Q6P1E8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab6Q6P1E8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms