Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Slx4Q6P1D7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Slx4Q6P1D7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Slx4Q6P1D7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms