Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Wdr44Q6NVE8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms