Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SphkapQ6NSW3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SphkapQ6NSW3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SphkapQ6NSW3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms