Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ltv1Q6NSQ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ltv1Q6NSQ7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms