Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg16l2Q6KAU8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg16l2Q6KAU8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms