Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mvb12bQ6KAU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mvb12bQ6KAU4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms