Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ParpbpQ6IRT3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ParpbpQ6IRT3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms