Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt40Q6IFX3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt40Q6IFX3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
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