Protein–RNA interactions for Protein: Q6DVA0

Lemd2, LEM domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd2Q6DVA0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lemd2Q6DVA0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lemd2Q6DVA0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms