Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbf1Q6DFZ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbf1Q6DFZ1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms