Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nop58Q6DFW4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nop58Q6DFW4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms