Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cep290Q6A078 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep290Q6A078 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep290Q6A078 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep290Q6A078 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cep290Q6A078 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms