Protein–RNA interactions for Protein: Q6A065

Cep170, Centrosomal protein of 170 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170Q6A065 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cep170Q6A065 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cep170Q6A065 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep170Q6A065 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep170Q6A065 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cep170Q6A065 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cep170Q6A065 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms