Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Jmjd1cQ69ZK6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms